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中農海稻研發團隊以海水稻為核心種質，創制了大量耐鹽堿、特色優異種質資源。目前已收集、創制了近300份海水稻（耐鹽堿稻）特色種質資源，培育出了20多個海水稻（耐鹽堿稻）功能稻米新品種（品系）。
獨創的海水稻（耐鹽堿稻）“秈粳架橋+功能基因分子定向選育”技術體系，突破了傳統育種方式遠源不親和的問題，擴大了基因交流的范圍，從而快速、穩定地培育新品種。同時采用“基因組+代謝組”的大數據分析方法，建立“基因-中間表型-高階表型”研究模型，尋找抗性基因，開發分子標記，加快育種進程。使用快速定向篩選，能夠節省60%以上的人工成本，將新品種培育周期減少50%以上。